核心保护区内的3A级风景区
湿地的减少固然是遗鸥离去的原因之一，但也有鸟类专家认为，不可忽视的是，在湿地尚存时，人为干预就在相当程度上影响了遗鸥的繁殖。
何芬奇是最早研究保护区内遗鸥的专家。他在2004年发表的一篇文章中认为，该年“遗鸥在保护区的零繁殖记录完全是人为原因。2004年4月中旬，至少曾有上千只遗鸥已在桃-阿海子原湖心岛的位置上刨挖浅坑准备筑巢却又离去，即是明证。”
何芬奇所指的人为因素，包括在保护区内发展的旅游业，他在文章中写到，在自治区级保护区业已划定之后，当地不仅搞旅游规划 “继之而来的是，复又报批了国家3A级风景名胜区，旅游设施的建设要远快于保护区的建设。”
这个3A级风景名胜区被命名为世珍园，据内蒙古自治区旅游局网站显示，世珍园被批准成为3A级旅游景区是在2002年，即保护区晋升为国家级保护区后一年。
在鄂尔多斯市环保局的官方网站上，至今依然能看到对该景区的推荐，“世珍园旅游区旅游活动项目有：越野车、卡丁车、骑马、射箭、滑草、快艇、摩托艇、脚踏船等。”
保护区管理局局长邢小军回忆，1997年世珍园被引进时，正值市林业局向内蒙古自治区申报遗鸥保护区为省级自然保护区期间，保护区管理局尚未成立。
邢小军说，当时，市林业局极力反对该项目，但是当时东胜市主要负责人却态度坚决，“最后市长说，我们一定在保护好鸟类的情况下发展旅游业，人家的地盘人家说了算，我们也没办法。”
记者了解到，相当长时间内，东胜区对开发保护区旅游热情不减。2002年成立了保护区东胜管理站。一份东胜区委机构编制委员会的文件显示，之所以要成立保护区东胜管理站，原因之一是为了“进一步促进东胜旅游业的发展”，而管理站的职能之一就包括“做好与旅游开发部门的协调工作。”
世珍园开业数年，保护区管理局的工作人员和当地村民都印象深刻，开发商在桃-阿海子北面围起一片区域，收取20元每张的门票。
“那个时候从北京到包头的火车上，都贴着旅游公司做的广告，用遗鸥的图片招揽旅游，”观鸟爱好者钟嘉说：“我坐火车的时候一看，天呐，一个国家级自然保护区居然拿自己保护的物种做旅游广告。”
邢小军介绍，2001年遗鸥保护区晋身为国家级保护区后，世珍园的经营范围并未缩减，其经营范围从实验区一直蔓延到核心区。
根据《中华人民共和国保护区管理条例》规定，自然保护区可以分为核心区、缓冲区和实验区。
其中，自然保护区内保存完好的天然状态的生态系统，以及珍稀、濒危动植物的集中分布地，为核心区，除特经批准外，禁止任何单位和个人进入。核心区外围是缓冲区，只准进入从事科学研究观测活动。缓冲区外围划为实验区，可以进入从事科学实验、教学实习、参观考察、旅游以及驯化、繁殖珍稀、濒危野生动植物等活动。
邢小军表示，虽然保护区的核心区不能办旅游，但是他们隶属于林业部门，对于旅游公司没有管理权，情况上报政府后，也并未得到改善。
保护区东胜管理站站长任永奇介绍，随着保护区湿地面积减少，世珍园没有游客来，在2006年主动停业。“但是为时过晚，遗鸥已经不来保护区栖息。”
2016年世珍园遗留的建筑被拆除大半，但还有一些少量的痕迹留在保护区内，三层楼的酒店离湖不远，码头向沙化的湖泊延伸，凉亭仿佛干枯的蘑菇散落在岸边。
世珍园原总经理余银说，目前正在和政府协商赔偿问题，其他方面不便透露。
千余万投资后湖水干涸
面对日益减少的湖水，鄂尔多斯市相关部门也曾进行过一次规模较大的治理。任永奇回忆，2004年前后，东胜区林业局申请过一次遗鸥保护区湿地保护项目，以期恢复湿地生态。
根据内蒙古自治区发改委相关文件显示，针对该项目，2006-2008年中央和地方一共投资1836万元。
一份2011年完成的报告显示，中央投资的1468万元全部使用，项目包括人工恢复植被、建立气象站、清理河道土方等，但报告并未提及地方投资额的使用情况。
然而，该项目完成后，保护区湿地并没有马上恢复，反而消失更严重——2008年桃-阿海子完全干涸。
任永奇介绍，当年该项目的直接负责人是东胜区林业局领导，项目的直接目的不在恢复湿地，而是改善生态环境，
他解释道，以清理河道为例，虽然淤地坝无法挖开，但是一些河道下游还是能连接到保护区，降雨时会有少量水源汇入。“当时因为干旱多年，河道里都是沙土和杂草，我们进行了清理，这样以后有降雨河道就会顺畅。这两年降水多，就有水汇入了。”
东胜区林业局副局长苗荔表示，虽然自己的分管范围包括遗鸥保护区东胜管理站，但自己在2013年才来到林业局，此前的事情并不清楚。
现任鄂尔多斯科技教育创业园管委会主任方立妍是苗荔在区林业局的前任，2008年区林业局《关于调整局领导班子成员分工的通知》显示，她的分管范围包括遗鸥自然保护区东胜管理站。记者联系到方立妍试图了解该项目，但是她表示，“那和我没关系，我从来没有分管过遗鸥。”
“十年前积极补救还可能恢复”
在此次中央环保督察组来到之前，遗鸥保护区的问题已经被环保部意识到。
东胜区林业局的一份文件显示，2015年隶属环保部的华北环境督察中心对保护区进行了执法督察，并提出了存在问题。
当年，鄂尔多斯市投入了680万元，对保护区内各村进行环境整治，包括修建渗水井、垃圾回收站，硬化道路，拆除残垣断壁等。
今年7月13日，中央第一环保督察组进驻内蒙古自治区，开展为期一个月的督察工作。
东胜区政府的一份文件显示，7月8日鄂尔多斯市委市政府召开迎接中央环保督察的会议，附件列举了东胜区重点环保清单，其中明确提到遗鸥保护区内“存在养殖场、围猎场等开发建设活动”，要求林业部门牵头，在10月底前限时完成整改。
据东胜区政府今年7月的一份资料显示，遗鸥自然保护区整治，由林业、国土、水务、农牧、环保和镇政府联合实施。11处违建清理7处，剩下4处已经关停，正在清理中。
在被中央环境督察组点名批评后，鄂尔多斯市又进一步加大了整治力度。
“明显这次市里区里很重视了，政府已经开了几次会，着急得厉害，一级一级政府很快设计方案。”保护区管理局局长邢小军说。
对于鄂尔多斯市政府现在的整治，在保护区研究超过20年的何芬奇认为，“十年前积极补救还可能恢复，但到了现在，就像中央督察组说的，保护区已经丧失了生态功能。”
新京报记者 刘子珩鄂尔多斯报道